冷冻干燥机系由制冷系统、真空系统、加热系统、电器仪表控制系统所组成。主要部件为干燥箱、凝结器、冷冻机组、真空泵、加热/冷却装置等。冻干机相对常规方法，冻干法具有如下优点：
许多热敏性的物质不会发生变性或失活。医学教育网收集整理。
在低温下干燥时，物质中的一些挥发性成分损失很小。
在冻干过程中，微生物的生长和酶的作用无法进行，因此能保持原来的性状。
由于在冻结的状态下进行干燥，因此体积几乎不变，保持了原来的结构，不会发生浓缩现象。 干燥后的物质疏松多孔，呈海绵状，加水后溶解迅速而*，几乎立即恢复原来的性状。
由于干燥在真空下进行，氧气极少，因此一些易氧化的物质得到了保护。
干燥能排除95%～99%以上的水分，使干燥后产品能长期保存而不致变质。
因物料处于冻结状态，温度很低，所以供热的热源温度要求不高，采用常温或温度不高 的加热器即可满足要求。如果冷冻室和干燥室分开时，干燥室不需绝热，不会有很多的热损失，故热能的利用很经济。
正所谓没有的技术，真空冷冻干燥技术的主要缺点是成本高。由于它需要真空和低温条件，所以真空冷冻干燥机要配置一套真空系统和低温系统，因而投资费用和运转费用都比较高。